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單細胞測序

可提供從單細胞水平對mRNA、染色質區域、CNV、免疫組庫的研究,解決組織樣本無法獲得不同細胞間異質性信息或樣本量太少無法測序的難題。

10x Genomics單細胞轉錄組測序

利用油包水的微反應體系,通過序列標簽區別群體中的不同細胞,獲得單細胞水平的數字化基因表達譜,實現數千甚至數萬個單細胞群體分析。

10x Genomics單細胞ATAC-Seq

在單細胞水平對細胞染色質開放區域進行研究,繪制細胞染色質開放區的單細胞圖譜,是單細胞水平研究表觀遺傳學的有效手段。

10x Genomics單細胞免疫組庫測序

實現在單細胞水平同時實現免疫組庫分析(TCR和BCR)和5’端基因表達譜分析,為免疫組學研究提供更具擴展性的平臺。

10x Genomics單細胞CNV

不但能夠實現在單細胞DNA水平檢測CNV和罕見克隆,而且能很好地解決群體平均化所帶來的問題,為揭示基因組異質性、理解克隆進化提供了可擴展的解決方案。

10x Genomics Visium空間轉錄組

將基因空間表達可視化,在識別不同細胞群的同時保留空間背景,提供了關于組織微環境中細胞功能、表型和位置關系的關鍵信息。

文章案例

單細胞轉錄表達譜分析揭示4個hiPSC亞群

10x Genomics Single Cell RNA-Seq鑒定18787個人類誘導多能干細胞的不同起始亞群

轉錄表達譜是發現調控未分化狀態關鍵基因和基因網絡的中心。由于細胞間基因表達具有高度異質性,單細胞RNA測序(scRNA-seq)可以用來加深人們對個體多能細胞功能的理解。研究人員通過10x 單細胞轉錄組測序研究了18787個人WTC CRISPRi 人誘導多能干細胞,確定了為每個亞群定義的新基因和其通路,并且開發了一個多基因預測模型對單細胞進行精確亞群分類。這為擴展對多能細胞復雜性的理解提供了一個基準單細胞數據集。

參考文獻:Quan et al., Single-cell RNA-seq of human induced pluripotent stem cells reveals cellular heterogeneity and cell state transitions between subpopulation. Genomic Research, 2018.

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