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轉錄調控測序

通過高通量測序獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的轉錄本序列信息,廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。

轉錄組測序

也稱RNA-Seq,能夠獲得某一物種特定組織或細胞在某一狀態下轉錄的所有mRNA序列信息,分析基因表達水平、差異表達基因、可變剪切、基因融合、基因結構優化、SNP、SSR和預測新轉錄本等。

全長轉錄組測序

基于PacBio單分子實時測序技術,直接獲得從5’末端到3’PolyA尾的高質量全長轉錄本序列,從而對同源異構體、可變剪接、融合基因、同源基因等進行精確分析。

全轉錄組測序

應用RNA-Seq技術,構建兩種文庫(small RNA文庫和去rRNA的鏈特異性文庫),對四種RNA(miRNA,lncRNA,mRNA,circRNA)的表達及調控關系進行分析。

文章案例

通過RNA-seq分析表明組蛋白巴豆?;揎棇D錄的調控具有重要的作用

RNA-seq分析揭示組蛋白巴豆?;揎棇D錄的調控的重要作用

發生于組蛋白賴氨酸上的翻譯后修飾,如甲基化和乙?;谵D錄調控、DNA損傷修復、DNA復制等生命過程中起著重要調控作用,組蛋白巴豆?;男揎椧蚱鋸V泛發生于組蛋白并與基因表達活化相關越來越受到研究者的重視。華東師范大學翁杰敏課題組的研究人員進行了一項研究,該研究通過篩選大量保留去組蛋白巴豆?;拿富?,但是喪失了去組蛋白乙?;拿富钔蛔凅w,然后在HeLa細胞中構建了HDAC1及HDAC1-VRPP的可誘導型穩系,通過RNA-seq分析表明去組蛋白巴豆?;揎椫罂梢悦黠@的抑制細胞的整體轉錄水平,系統的證明了Ⅰ型組蛋白去乙?;福℉DAC)是細胞中關鍵的組蛋白去巴豆?;?,并且首次表明巴豆?;确且阴;揎椩谵D錄調控中可能具有廣泛地與乙?;坏韧闹匾饔?。

參考文獻: W wei et al., Class I histone deacetylases are major histone decrotonylases: evidence for critical and broad function of histone crotonylation in transcription. Cell Research, 2018.

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